人族部落之中，自神农接位之后，一直兢兢业业，努力让人族过上更好的生活。
现在人族部落虽然比较强盛，但是洪荒上的生存环境何其危险？无论是变幻莫测的天气还是毒蛇猛兽，尽皆威胁着人族的安全。
一日，神农正在处理政务，忽然听到外面一阵喧哗，神农一皱眉，走到屋外，眼见人族围成一个圈子，好似在围观什么。
有眼尖的人族瞅见神农走来，大喝一声，“共主来了。”众人齐齐转身朝神农施礼，神农摆摆手，“尔等何事再次喧哗围观。”
一个壮年汉子上前解释道：“启禀共主，是有人误食了毒果中毒了。”
神农眉头一皱，分开围观的人族，走近中毒之人，打量了一下在地上躺着的人，三十多岁的样子，脸色紫涨，摸了摸脉，心中已然知晓了毒性大概为何。
单手抵住中毒之人的胸口，运起法力将毒素全部逼到指尖上，另一只手虚空一划，中毒的人指尖出现一个伤口。
大滴大滴的紫黑色鲜血自指尖流出，足足过了一刻钟，才将毒素清除干净，吩咐下去将人抬走好生照顾，神农眉头紧锁的回到了屋里。
一夜思考未果，神农来到山上想自己的老师玄都大法师请教。玄都微一沉吟：“你可记得为师赐你的那赭鞭？若想知道哪些植物有毒，哪些植物无毒，你当自己亲试，那赭鞭可助你一臂之力。你可有毅力完成此事？”
神农点点头，神情坚定的道：“弟子定不会辜负老师的期望。”
第二天，神农将部落的事安排好之后便向大山深处兴趣，一路之上，所见到的草木全都用赭鞭打了一下，观其有毒无毒，然后将它们记录下来。等到晚上之时，再将那些毒草和药草服下，检验其毒性。
随着不断地试药尝百草。神农发现，各类草药都有五行之属，有些厉害的药草更是含有数种五行之力。可从其寒，温，平，热之性，研究解毒之术。
这一日，神农在石缝中看到一条开着小黄花的藤状植物，赭鞭打了一下，发现此草蕴含剧毒。
神农摘下花叶疼吃到肚子里，没过多久就感到腹痛不止，好似钻心一般，连忙运转法力将毒性化解，擦了擦头上的冷汗叹道：“幸好我一证天仙道果，不然怕是就要死在这里了。”
将这药草记录下来后自语道：“既然吃了之后，腹痛钻心，好似肠子断裂一般，就叫断肠草吧。”
因为尝百草，神农时时刻刻处于危险之中，最高纪录曾经达到过一日中毒七十次。
时间日久，将各类常见之物和不常见之物，一一写在书里，历时十八年才完成。
尝完百草之后，便开始研究药理为人族治病，人族何其众？每日前来看病求医之人多不可数，神农一边看病，一边研究治病之法写在药经之上，到后来，神农一边游历为人族治病，一边传授其他人族医道为人族治病。
在陈郡的西北方有一个部落叫有熊，靠近轩辕之丘，部落的首领名字叫少典取附宝为妻。
有天晚上，附宝见一道电光环绕北斗七星，天枢星上白光闪耀，天枢星忽然而落，附宝由此感应怀孕。
这一日，原始天尊算得轩辕即将出世，在玉虚宫的原始天尊命白鹤童子将金钟敲响。
金钟敲响，不过片刻，阐教的十二金仙，和燃灯道人，云中子，南极仙翁尽皆来到原始天尊身前。
众仙朝着原始天尊拜道：“弟子拜见老师，老师圣寿无疆。”
原始天尊睁开双眼，眼中神光射出三尺多远，抬头打量了一眼众仙，微微点了点头：“此番唤尔等前来，乃是因为三皇之中的人皇即将出世，人皇欲证道果，须经历一番刀兵之祸，贫道今遣尔等下山，寻访人族，将人皇收入门下，传授我玉清大法。人皇将于轩辕之丘附近出世，人皇有难之时，你等可辅助人皇。”
众仙心中一喜：“三皇帝师乃是大功德之事，谁不想要？”
原始天尊满意的看了一眼下方的众仙反应，开口道：“广成子，你且上前。”
广成子听命上前，原始天尊自袖中取出一方三寸大小的宝印，仙光袭人，宝光流转，底部刻着两个古篆，正是翻天二字。
原始天尊道：“前翻为师曾赐下扫霞衣，落魂钟，今日便将这翻天印赐你防身。此物乃是为师取不周山断石炼制，威力极大，你当慎用。”
广成子心中大喜，双手捧印拜谢接过。
原始天尊继续道：“赤精子，前翻为师赐予你紫绶仙衣，水火烽，今日赐你阴阳镜，权作护身之用。
太乙：“前翻赐下你乾坤圈，混天绫，今番赐你九龙神火罩，黄龙，这龙珠乃是为师早些年所得，便赐予你用。”
文殊：“你已有拐扁，今日赐你这遁龙桩，玉鼎，赐你斩仙剑，普贤，你已有长虹索，赐你吴钩剑，慈航，这琉璃清净瓶赐你防身，清虚，你已有攒心钉，赐你莫邪剑，五火七禽扇，道行，赐你降魔杵，燃灯，赐你紫金钵盂，云中子，赐你照妖镜，水火花篮，南极，赐你清净浮尘，灵宝赐你神煞葫芦。”
十二金仙得了宝贝，喜滋滋的出了昆仑山，回到各自道场炼化法宝，准备到时辅助人皇成道，获取功德之气。
少典刚刚喜得贵子，听闻有修士前来，不敢怠慢，放下手中的孩子，急忙迎了出来。
到了门口，眼见三个道人站在门外，为首一人，头戴鱼尾冠，身穿扫霞衣，手里拿着一柄拂尘，正是那阐教十二金仙之首的广成子。
旁边一人，身穿龙袍，背背仙剑，乃是十二金仙之中的黄龙真人，最后一人身穿月白道袍，头戴一字巾，手里提着水火花篮，正是阐教中有名的福德真仙云中子。
广成子见少典刚一出来，朝少典打了个稽首：“贫道阐教玉清圣人门下，九仙山桃源洞广成子，今算得令公子出世，此子与贫道有缘特来收于门下。”
少典一听大喜，要知道前两位人皇都是刚出生便被圣人弟子收为弟子的事，早就传遍了整个人族，如今少典儿子出世，就有人来收弟子，少典能不惊喜吗？
“得仙长抬爱，实是犬子的福分，犬子还未起名，请仙长赐名。”
广成子微微一沉吟：“他生于轩辕之丘，便起名轩辕吧。”
少典大喜道：“好好好，就叫轩辕。”
广成子在有熊部落附近的一座山上开辟了个临时洞府，而黄龙和云中子却是回到各自道场，广成子平时无事，尽力教导轩辕，时间一晃就是十八年。
……
且说当初巫妖大战之后，最终巫族虽然损失惨重，但是却也有不少的巫族得以存活。而活下来的大部分巫族被平心娘娘带入六道轮回幽冥界和退守盘古殿北方百万大山，但还是有一部分巫族行走于洪荒之上。
而巫妖大战之前，人族跟巫族结合，生下混血的人巫一族，后来人巫一族在经过了伏羲跟神农治世这将近两千多年的时间发展？，形成了一个有着近千万人口大型部落，这个部落自成为九黎一族。
因为体内有着巫族战斗的血液，再加上伏羲跟神农的教化没有普及，因此九黎一族民风尚武，个个身强力壮，武艺高强，只是没有经过教化，他们的性格极是蛮横，斗殴乃是常有之事。
而就在轩辕诞生的那天，九黎一族上空天有大变，方圆千里之地尽暗，云层中更有红黑色闪电纠结交缠，血色光辉降下于九黎族中，更有万鬼齐哭于天，吓得一干族人心惊胆战不已，纷纷关紧门窗躲避在家里不敢出来。
如此持续了三日，方才散尽异象，却有九黎族族长之妻诞下一麟儿，哭声震天，直将天上的浮云震散。那婴儿小小年纪便长得浓眉大眼，叫声响亮，手腿壮硕且头上长角。族长大喜不已，认为是天将神子于他，并为他取名为：蚩尤，将希望都寄托在蚩尤身上。
蚩尤乃是天生神力，少时就以力大闻名于族中。每次在族中的比武中蚩尤都大获全胜，且其为人豪爽异常，那些战士因其武勇，故而对他言听计从，小小年纪就在族中的威望甚高，族长看后心中兴奋不已，暗叹九黎族终于有了传人！
且蚩尤生而有大神通，能操纵天地间的元素力量，更为让族人敬重的是他身体极具强悍，莫说寻常的刀刃，即便是神兵利器也无法在他身上留下一丝一毫的痕迹，皆谓为天人也！
蚩尤，原本是巫族大巫之一，得后土祖巫精血，除了成就祖巫真身之外，竟然无缘无故真灵可以脱离肉体，此事震惊巫族，十二祖巫当时费尽苦心却不能找出原因，只能遗憾了事。
而巫妖大战之后，十一祖巫跟妖族的几位妖皇一起同归于尽，唯独蚩尤活了下来，蚩尤并且不甘心巫族衰落，请求平心娘娘让自己一丝真灵携带祖巫精血投入六道轮回转世，不知何故居然与轩辕同一天降世，看来注定要与轩辕有那一战。
眨眼间几十年过去了，蚩尤也变得更加成熟了，同样蚩尤也做出了自己的贡献。例如他发明了弓箭、长矛，增加的捕猎的容易程度，改善了族人生活水平。后来他也将一些普通巫法传给百姓，使百姓能够改善体质，寿命变长，如此等等，蚩尤在九黎部落中声望无两。
而随着蚩尤在九黎部落的威望越强，他的父亲也越是高兴，终于在蚩尤四十九岁的时候，他的父亲将九黎族族长的位子传给了他。
而随着九黎族长的位子落在蚩尤的手中，没过多久，蚩尤便凭借着人族的气运觉醒了自己沉睡的祖巫血脉，恢复了大巫之身。在恢复了大巫之身后，蚩尤前世的记忆也随着觉醒，神通也恢复了七成有余。只是看着如今早已没落的巫族，蚩尤心中却是兴起了复兴巫族的心思。
而另一边，少典去世，轩辕继任有熊部落的族长之位，这一日，有熊部落来一人，手持赭鞭，背着一个竹筐，皮肤黝黑。正是游历洪荒的神农。
神农三年前将多年行医的经验和医理编制成书取名叫做《神农百草经》，此书一成，神农只觉心中空灵一片，心知大道已成，便四处游历洪荒，一边传授丹道医理，一边寻找自己的接班人。
直到今日，来到有熊部落，听说轩辕被玉清圣人门下收为徒弟之时，便知道轩辕十有八九便是自己要找之人。
叫人去将轩辕请来，轩辕得知是共主神农前来，急忙恭敬的迎接进部落之中。
屋内，神农见轩辕丰神俊朗，生的是一表人才，心中甚是满意。笑道：“听闻轩辕部落出了一位大贤，福缘深厚，竟然拜在玉清圣人门下，吾心甚喜，今日一见，果然名不虚传。”
轩辕谦虚道：“皆是师父教导有功，轩辕不敢居功，倒是听闻共主种五谷而饱天下，养六畜而兴天下，治丹药而医天下，乃是继天皇伏羲之后的又一位大贤，心中向往已久，今日得见，吾心足矣。”
神农与轩辕坐下后，因为一拜玄都为师，一拜广成子为师，又都是天定三皇之一，互称兄弟，聊得甚是投机。
神农问了轩辕一些有关民生部落管理之事，轩辕对答如流侃侃而谈，时而发表自己的见解，不少见解让神农眼前一亮，久聊之下，发现轩辕果真学识渊博，便表示了自己的退位让贤之意。
轩辕心怀天下，也不推脱，二人商议三个月后，举行接位大典。
三个月后，到了神农证道的日子，陈郡站满了前来管理的人族，高台上供奉着人族圣母女娲娘娘，人祖皇天氏，三清教主和天皇伏羲的神像，广成子身为轩辕的师父，便赶了过来。
玄都是神农的师父，也站在高台上观礼，神农走上台，忽然间天光大亮，一架有九匹龙马所拉的辇车自天外飞来，一声朗笑自撵上传出：“这些年来辛苦皇弟了，如今皇弟证得地皇道果，真是可喜可贺啊。”
广成子和玄都听得清楚，知道是天皇伏羲来了，神农一见是天皇伏羲来了，急忙迎接，一番见礼之后，玄都大法师取出三清符诏朗声念道：“奉玄门三清天尊敕令，人族共主神农自接任人皇以来，天下大治，务利至己矣，不望其报，不贪天下之财，而天下共富之；不以其智能自贵于人，而天下共尊之。今可得道，飞升火云宫，当历无量量劫不灭！另着人族公孙轩辕继位。”
神农拜了三拜，双手接过三清符诏，与轩辕一起登上高台，拈香拜了三清女娲和皇天氏的神像三拜，朝下方人族高声道：“神农自成为共主以来不敢有丝毫懈怠，天幸如今下任共主已出，神农也可放心离去，今日神农禅位，天下共知！”言罢从袖中取出人皇至宝皇天印，捧着来到轩辕面前，表情严肃地说道：“轩辕，今日我把人族的未来交到你的手中，你定要将我人族带领壮大，莫要辜负了人族的期望！”
轩辕双手接过皇天印，举过头顶，朝三清拜了一拜，跪倒在广成子身前高声道：“今日轩辕接掌大位，必不负师父教导，不负地皇所托，望天佑我人族。”
这时，天边飞来一片巨大地七色功德霞光，一分为三，八成落在神农身上，神农立时证了地皇道果，身显五色霞光，直冲天际，仙音阵阵，金莲乱涌，修为瞬间突破准圣，此时神农正是纯粹的人族中除了滋衣氏之外唯一以人族之身成就的准圣大能。
而另一份约一成左右的功德落在玄都大法师身上，乃是有感玄都大法师教导人皇有功，以示奖励，功德临身，玄都大法师立时突破，斩去善尸，成就准圣修为。
还有一成一份为二，涌入赭鞭和造化鼎中，成为两件功德圣器。
神农上了玉辇，转身对轩辕笑道：“皇弟，自此人族就交给你了，吾与伏羲皇兄在火云洞内等你。”说完朝广成子和玄都拱了拱手，与伏羲大笑着乘辇往火云洞而去。
自此，轩辕接受人族共主之位，只是轩辕出生之时，正逢蚩尤降世，北斗冲七煞，自身沾染杀气，出生以来好武成风，不像前两代人皇一般以仁义治天下，且此时洪荒之中部落林立，人族四分五裂一盘散沙，轩辕身负一统人族的大任，注定要在将来掀起一场腥风血雨。